(Gestão 2010-2014)
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Direção: Dra. Eunice C. Machado
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Vice-direção: Dr. José Guilherme Bersano Filho.
O CEM foi criado como unidade de pesquisa da Universidade Federal do Paraná em 1980, quando foi organizado, ainda em Curitiba, o primeiro núcleo de pesquisadores. Datam desta época o primeiro organograma da instituição, então denominada Centro de Biologia Marinha (CBM), instalação dos primeiros laboratóriose a definição de alguns objetivos básicos de pesquisa. Nesta fase, o CBM esteve vinculado ao Setor de Ciências Biológicas, não possuindo lotação própria. Seus pesquisadores estavam lotados em outros Departamentos da Universidade ou eram convidados de outras instituições.
No entanto, o CBM só foi formalmente criado por decisão do Conselho Universitário da UFPR em 13 de março de 1982, como órgão suplementar da Universidade. A decisão foi homologada pela Portaria Ministerial número 181, de 2 de maio de 1983.
Os primeiros laboratórios localizavam-se em Curitiba, nas dependências do Departamento de Educação Física. A seguir foram instalados no prédio da Travessa Alfredo Bufren e depois no Setor de Ciências Agrárias. Com a inauguração da sede litorânea em Pontal do Sul, em 13 de março de 1982, iniciou-se a transferência progressiva dos laboratórios, processo que só se encerrou em 1984.
A partir de 1988, novos laboratórios foram criados, nas áreas de geologia, química marinha, oceanografia física e gerenciamento costeiro, levando a uma reestruturação da unidade quanto a seu alcance e áreas de atuação. Entre o segundo semestre de 1988 e fevereiro de 1991, o Centro esteve diretamente ligado diretamente à reitoria da UFPR. Um novo regimento foi aprovado pelo Conselho Universitário em dezembro de 1992, concretizando a criação do atual Centro de Estudos do Mar (CEM), quando o CEM passou para a Pró-Reitoria de Pesquisa e Pós Graduação, tendo retornado a depender da Reitoria até 1999. A partir deste ano, o CEM passou a depender do novo Setor de Ciências da Terra da Universidade Federal do Paraná, do qual fazem parte, também, os Departamentos de Geografia,Geomática e Geologia.
O Diretor do CEM é escolhido por professores, funcionáriose alunos da unidade, através de eleição direta.
Os principais financiadores de projetos têm sido a Comissão Interministerial para os Recursos do Mar (CIRM), o Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq), o Programa de Recursos Humanos em Áreas Estratégicas (RHAE), a Petrobrás, o Ministério da Ciência e Tecnologia e o Conselho de Ciência e Tecnologia do Paraná (CONCITEC).
Sediado em Pontal do Sul, o CEM possui um prédio central de 2000 m2 de área construída, abrigando gabinetes de professores, laboratórios especializados, biblioteca, auditório, laboratórios gerais, câmaras frigoríficas e de temperatura constante, salas de administração, etc. Outros três edifícios abrigam salas de aula, laboratórios de ensino e de informática e o restaurante universitário (RU). A frota de pesquisa conta com várias pequenas embarcações e dois barcos de médio porte. A Bibliotecado CEM foi criada em 1982, tendo se originado em grande parte do acervo particular do falecido bioquímico Prof. Gilberto Vilela. Atualmente faz parte do Sistema de Bibliotecas da Universidade Federal do Paraná (UFPR), contando com pessoal especializado para o atendimento e organização do material.
A equipe científica do CEM é atualmente composta por 24 professores do quadro permanente da UFPR todos doutores que, juntamente com graduandos, graduados, mestrandos e doutorandos, são responsáveis pela estruturação dos laboratórios de pesquisa.
O quadro técnico-administrativo é composto por cerca de 30 funcionários de carreira da UFPR, contratados pela FUNPAR ou terceirizados.
Em 2000, foi fundado o curso de Ciências do Mar do CEM, que passou para Oceanografia em 2004, antes da formatura da primeira turma. Em 2009, começou a funcionar o segundo curso de graduação (tecnológico) do CEM, de Aquicultura. Em 2006, começou a funcionar no CEM o curso de pós-graduação em sistemas costeiros e oceânicos (PG-SISCO), que atualmente possui o conceito 4 da CAPES.
