A atualização do plano de amostragens foi realizada após visitas e análises de amostras coletadas durante projetos anteriores realizados nessa região, assim como uma revisão dos principais fatores da área de estudo tais como fontes poluidoras, etc. O levantamento preliminar dos pesquisadores de Hyogo em fevereiro de 2004 (e novembro de 2006), foi de extrema ajuda para a escolha dos locais de amostragem. Todos os parâmetros da qualidade da água serão coletados simultaneamente para evitar influências indesejáveis nos dados. Após a discussão final com os pesquisadores de Hyogo e a equipe de trabalho (IAP, SEMA, IBAMA, PUC-PR e CEM/UFPR) em novembro de 2006, foram definidas as seguintes estações do Complexo Estuarino da Baía de Paranaguá (Figura I):

Eixo Leste-Oeste:

1 - Ponta da Pita
2 - Europinha
3- Porto de Paranaguá
4– Rio Itiberê

Eixo Norte-Sul:

5 – Ilha do Mel
6– Medeiros
7 – Benito
8- Pinheiros

A qualidade da água será avaliada em Fevereiro de 2007 e Julho de 2007 em oito estações selecionadas (figura 1). Em cada estação, será executada determinação direta (in situ) da transparência da água, salinidade, condutividade, temperatura, oxigênio dissolvido na superfície (0,5m) e fundo. Em acréscimo, amostras de água serão coletadas utilizando uma garrafa de Van Dorn de 3,5 litros para análise de DQO, DBO, alcalinidade e CO2, nutrientes inorgânicos dissolvidos (nitrato, nitrito, amônia, fosfato, e silicato), séston, clorofila a, partículas de carbono orgânico e nitrogênio, fósforo total. Além desses, amostras de água para análise bacteriológica como Coliformes Totais e E. coli serão coletados. E também uma avaliação do padrão de distribuição das bactérias, a localização dos pontos críticos de contaminação e a identificação da origem e como se espalha.

Sedimentos da superfície dessas estações serão coletados com a ajuda da amostra de sedimento (Van Veen Graber) e analisados para Ni, As, Cu, Cd e Hg e hidrocarbonetos de petróleo. Água Intersticial das amostras de sedimento serão extraídos e usados para testes apurados de toxicidade. Em acréscimo, análises de POC, PON e POP serão realizados. As variáveis pesquisadas e respectivos métodos de análises estão apresentadas na Tabela I e Tabela II.